所有的叶绿素和绝大部分类胡萝卜素都被埋藏

3.藻色素

藻色素（phycochrome）仅存在于红藻和蓝藻中，主要包括藻红素（phycoerythro-bilin）和藻蓝素（Phycocyanobilin）。藻红素呈红色，藻蓝素呈蓝色。藻色素类均溶于稀盐溶液中，都是色蛋白，即是由蛋白质和红色或蓝色的辅基（生色团）所组成的复合蛋白质。辅基和蛋白质结合得相当牢固，只有用强酸水解时，才能将它们分开。藻红素和藻蓝素的辅基，都是由4个吡咯环联成一串组成的。图3—8为一种藻红素（或称藻红蛋白）和一种藻蓝素（或称藻蓝蛋白）生色团的结构式。每一个藻蓝蛋白或藻红蛋白分子中不只含有1种辅基，一个藻蓝蛋白分子中至少有8个辅基。

所有的叶绿素和绝大部分类胡萝卜素都被埋藏在类囊体内，通过非共价键与蛋白质分子相连。全部叶绿体色素大约相当于类囊体膜脂质含量的一半，而其他的一半主要由半乳糖脂和少量的磷脂组成。

（二）叶绿体色素吸收光的原理

1.光吸收的基本原理

光是一种电磁波（electromagneticspectrum），具有波的性质和粒子的性质。光在光合作用中起作用的仅仅是具有可见光波长辐射能的部分（大约～纳米[nm]），是电磁波中非常狭窄的区域。光的粒子性质通常用量子（quanta）或者光子（photons）来表示：不连续的能级，具有特定的波长。每个光子的能量与其波长成反比。它们的关系为：

E=Nhv=Nhc/λ

式中E为能量，以焦耳（J）为单位；N为亚伏伽德罗（Avogadro）常数，6.02×；h为普郎克（Planck）常数，6.×10-34Jsphoton-1；c为光速，3.0×ms-1；λ为波长。当λ为nm（6.6×10-7m）时，光子的能量为kJmol-1；当λ为nm（4.5×10-7m）时，光子的能量为kJmol-1。所以紫色和蓝色波长的光子比橙色和红色波长的光子具有较高的能量。